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調剤薬局業界の市場規模・主要企業・動向

日本の調剤薬局は調剤医療費8.4兆円(2024年度)・薬局6.3万施設で、医薬分業率82%の成熟期に入り、2026年の報酬改定で立地と機能が問われています。

調剤薬局とは、医師の処方箋に基づいて薬剤師が医薬品を調剤し、服薬指導を行う保険薬局を中心とする産業です。2024年度の調剤医療費(電算処理分)は8兆4,008億円、薬局は63,203施設、処方箋受取率(医薬分業率)は82.2%(2025年度)に達し、医薬分業の量的な拡大は成熟しました。上場チェーン、調剤併設のドラッグストア、中小・個人薬局が併存するなかで、門前薬局の是正、後発医薬品と薬価、報酬改定への対応が共通の論点です。本ページでは、調剤薬局業界を、市場規模、薬局数と分業率、主要プレイヤー、業界構造、報酬改定と収益の5軸で整理します。

最終更新

業界サマリ

業界概要

調剤薬局とは、医師が発行した処方箋に基づいて薬剤師が医薬品を調剤し、服薬指導を行う保険薬局を中心とする産業です。医療機関で診察と薬の受け取りを分ける医薬分業が1990年代以降に広がり、外来患者のうち院外の薬局で処方箋を出した割合を示す処方箋受取率は82.2%(2025年度)に達しました。市場規模にあたる調剤医療費(電子レセプトで集計した電算処理分)は8兆4,008億円(2024年度)で、量的な拡大は成熟期に入っています。

  • 調剤医療費は8兆4,008億円で、薬剤料が7割・技術料が3割を占めます。薬剤料の大半は医薬品の仕入れ代金として流れるため、薬局の収入の柱は2兆3,251億円の技術料です。
  • 63,203の薬局と19万7,437人の薬局薬剤師が担い手です。上場チェーンや調剤併設のドラッグストアが規模を広げる一方、薬局の大半は中小・個人経営で、事業者の姿は多様です。
  • 「門前からかかりつけ・地域へ」の政策転換が進んでいます。特定の医療機関の処方箋に依存する門前薬局の割合はむしろ増えており、令和8年度の調剤報酬改定は、処方箋1枚ごとに算定する基本報酬である調剤基本料の見直しでその是正を図ります。電子処方箋は薬局の85.5%が運用を始めています。
基礎データ: 厚生労働省 調剤医療費(電算処理分)の動向 / 衛生行政報告例 / 医師・歯科医師・薬剤師統計 / 日本薬剤師会 医薬分業進捗状況 / 厚生労働省 令和8年度診療報酬改定の概要【調剤】

市場動向

調剤医療費(電算処理分)は2024年度に8兆4,008億円(前年比+1.6%)となり、2012年度の6兆5,902億円から約1.8兆円増えました。処方箋枚数は8億9,859万枚、1枚当たりは9,387円です。高齢化で枚数が増える一方、薬価改定と後発医薬品への置き換えが単価を抑え、市場は年1から2%程度の緩やかな拡大が続いています。

  • 調剤医療費は2015年度に7.8兆円台へ乗り、2023年度に8兆2,678億円、2024年度に8兆4,008億円となりました。2020年度は受診控えで前年度比▲2.6%と減りましたが、その後3年連続で増えています。
  • 処方箋1枚当たり調剤医療費は9,387円(2024年度)で、2020年度の9,863円からは下がっています。処方箋枚数は2020年度の7億6,497万枚から2024年度の8億9,859万枚へ回復し、枚数の増加が市場の拡大を支えています。
  • 後発医薬品の数量ベース割合(新指標)は2024年度末に90.6%に達しました。薬剤料6兆592億円のうち後発医薬品は1兆1,908億円で、数量では置き換えが進んだ一方、金額では新薬や注射薬(6,644億円)の比重が大きい構造です。
基礎データ: 厚生労働省 調剤医療費(電算処理分)の動向 年度版 (2012-2024年度)

競争環境

調剤薬局のプレイヤーは、上場する調剤チェーン(アインホールディングス・クオールホールディングスなど)、非上場の大手(日本調剤・総合メディカル)、調剤を併設するドラッグストア(スギ・ツルハ・サンドラッグなど)、中小・個人薬局の4つに分かれます。規模の経済と門前立地の是正、ドラッグストアとの競合、後継者難とM&Aによる再編が競争の論点で、2025年には業界2位の日本調剤が投資ファンドの買収を受けて株式を非公開化し、アインはさくら薬局を運営するクラフトを傘下に収めました。

  • 上場最大手はアインホールディングスで、2026年4月期の連結売上は6,478億円、営業利益は298億円です。クオールホールディングス(売上2,908億円、2026年3月期)、メディカルシステムネットワーク(1,322億円、2026年3月期)、ファーマライズホールディングス(695億円、2026年5月期)が続き、各社とも調剤に加えて医薬品製造や物販を手がけます。
  • 日本調剤は2025年3月期に連結売上3,605億円、調剤薬局753店の規模で業界2位級ですが、2025年12月に東証プライムの上場を廃止し、投資ファンドの傘下で再出発しました。2020年に経営陣による買収で非公開化した総合メディカル(そうごう薬局)も非上場の大手で、大手の一部は上場企業の枠外にあります。さくら薬局を運営するクラフトは2025年8月にアインホールディングスが持株会社の全株式を取得して子会社化しており、上位では再編が進んでいます。
  • ドラッグストアは調剤併設を広げています。スギホールディングス(連結売上1兆103億円、2026年2月期)、ツルハホールディングス(1兆4,506億円、2026年2月期。2025年12月に経営統合したウエルシアを3か月分含む)、サンドラッグ(8,425億円、2026年3月期)などの連結売上は物販が大半ですが、店舗網を生かした調剤の取り込みで、調剤専業チェーンと同じ処方箋を奪い合う関係にあります。ツルハは2025年12月にウエルシアホールディングスと経営統合し、ドラッグストア側の再編も進んでいます。
基礎データ: EDINET上場各社の有価証券報告書 (FY2019-2026) / 日本調剤の2025年3月期決算説明資料 / 日本経済新聞 (2025年12月の上場廃止報道)

市場規模推移

2012-2024 · 調剤医療費
単位: 兆円
0.002.505.007.5010.06.59126.997.157.82157.447.677.437.707.50207.717.838.278.4024
出典: 厚生労働省 調剤医療費(電算処理分)の動向 年度版 (2012-2024年度、電算処理分)
年度2012201320142015201620172018201920202021202220232024
調剤医療費(兆円)6.596.997.157.827.447.677.437.707.507.717.838.278.40
前年比—+6.1%+2.3%+9.3%-4.9%+3.0%-3.1%+3.7%-2.6%+2.8%+1.7%+5.5%+1.6%
市場規模の読み解き
調剤医療費の推移

調剤医療費(電算処理分)は、2024年度に8兆4,008億円(前年比+1.6%)となりました。2012年度の6兆5,902億円から12年間で約1.8兆円増え、2015年度に7.8兆円台へ乗った後は薬価改定の年に減り、翌年に戻す動きを繰り返しながら緩やかに拡大しています。2020年度は受診控えで前年度比▲2.6%と落ち込みましたが、2023年度には8兆2,678億円まで回復しました。

処方箋枚数は2024年度に8億9,859万枚で、処方箋1枚当たりの調剤医療費は9,387円(前年比+0.3%)です。枚数と1枚当たりは紙のレセプトを含む全数ベース(総額8兆4,347億円)の値で、電算処理分の総額8兆4,008億円とは0.4%の差があります。高齢化で処方箋の枚数が増える一方、後発医薬品への置き換えと薬価引き下げが1枚当たりの薬剤料を抑えるため、市場全体の伸びは年1から2%程度にとどまる構図が続いています。

⇒市場規模を詳しく見る

薬剤料と技術料、後発医薬品

調剤医療費の内訳は、薬そのものの代金である薬剤料が6兆592億円(72.1%)、調剤や服薬指導に対する報酬である技術料が2兆3,251億円(27.7%)で、残りは特定保険医療材料料165億円です。薬局の収入として手元に残るのは技術料であり、薬剤料の大半は医薬品の仕入れ代金として卸や製薬会社に支払われます。技術料は2012年度の1兆7,020億円から増え続けており、服薬指導など患者に向き合う対人業務への評価の積み上げが背景にあります。

薬剤料のうち後発医薬品は1兆1,908億円で、数量ベースの後発医薬品割合(新指標)は2024年度末に90.6%に達しました。数量ではほぼ置き換えが完了した一方、薬剤料に占める割合は年度平均で19.7%にとどまり、金額面では新薬や注射薬の比重が大きい構造です。注射薬の薬剤料は2012年度の1,719億円から2024年度に6,644億円へ増えています。

⇒市場規模の内訳を詳しく見る

⇒2026年の報酬改定を詳しく見る

処方箋の発行元と医薬分業の到達点

2024年度の調剤医療費を処方箋の発行元でみると、診療所発行が4兆8,934億円、病院発行が3兆4,761億円で、歯科などを除く医科発行の8兆3,695億円のうち診療所が6割弱を占めます。処方箋枚数でも診療所発行が7億1,163万枚と大半で、地域のクリニックの近くに薬局が集まる立地構造の背景になっています。

日本薬剤師会の推計では、処方箋受取率(医薬分業率)は2020年度の75.7%から2025年度に82.2%へ上がりましたが、2023年度に80%を超えて以降の伸びは小さく、日本薬剤師会ベースの処方箋枚数は2025年度に8億5,730万枚と前年度をわずかに下回りました。院外処方への移行という量的な成長は終わりに近づき、今後の市場は高齢化による枚数増と、薬価・後発品による単価減の綱引きで決まります。

⇒薬局数と分業率を詳しく見る

主要トピック

業界構造

主要プレイヤー / サプライヤー / 流通 / 需要
調剤薬局業界の構造
主要プレイヤー (2026年9月時点)
01
制度・規制・業界団体
上流
規制・報酬決定 (国・都道府県)
厚生労働省 (医薬局・保険局)
薬機法・調剤報酬 所管
薬局の開設許可制度、認定薬局制度、調剤報酬改定の概要、調剤医療費の動向の公表
中央社会保険医療協議会 (中医協)
2年ごとの診療報酬(調剤報酬)改定の審議、医療経済実態調査
都道府県 (薬務主管課)
薬局開設の許可、地域連携薬局・専門医療機関連携薬局の認定
業界団体
日本薬剤師会
薬剤師の職能団体。処方箋受取率(医薬分業率)の推計を毎年度公表
日本保険薬局協会 (NPhA)
保険薬局チェーンの業界団体。調剤報酬改定の影響調査、管理薬剤師調査
日本チェーンドラッグストア協会 (JACDS)
ドラッグストアの業界団体。調剤併設店舗の実態調査
02
薬局 (63,203施設、類型別)
中流
非上場の大手
日本調剤
売上 3,605 億円 (2025年3月期)、753店
2025年12月に東証プライム上場廃止 (投資ファンドの TOB で非公開化)。後発医薬品製造 (日本ジェネリック) も保有
総合メディカル (そうごう薬局)
2020年に経営陣による買収 (MBO) で東証一部上場廃止、非公開化。医療機関向けコンサルティングも手がける
中小・個人薬局 と 認定薬局
中小・個人薬局
地域連携薬局4,292件 (2026年8月末)
専門医療機関連携薬局225件 (2026年8月末)
健康サポート薬局3,592件 (2026年3月末)
03
医薬品の供給と薬局のインフラ
供給側
製薬・後発医薬品メーカー
新薬・後発医薬品メーカー
薬剤料 6兆592億円の供給元。後発医薬品の数量シェアは 90.6% (2024年度末)、供給不安への対応が課題
バイオ後続品 (バイオシミラー)
令和8年度改定でバイオ後続品調剤体制加算を新設
調剤機器・システム・DX
調剤機器・レセプトコンピュータ
調剤ロボット、薬歴システム、レセコン
電子処方箋・オンライン資格確認
電子処方箋を運用する薬局は 85.5% (2025年9月)、医療機関側の普及が課題
04
処方箋の発行元と患者・保険者
需要側
処方箋の発行元 (医療機関)
診療所
調剤医療費 4兆8,934億円 (2024年度)
処方箋発行の大半。門前薬局・医療モールの立地の起点
病院
調剤医療費 3兆4,761億円 (2024年度)
敷地内薬局の論点、専門医療機関連携薬局との連携
患者・保険者
患者 (処方箋 8億9,859万枚)
高齢化で枚数が増加。かかりつけ薬剤師・薬局の選択
保険者 (健康保険組合・協会けんぽ・国保・後期高齢者医療)
調剤報酬の支払い側。医薬分業率の分母となる外来受診
業界構造の読み解き
業界の構造

調剤薬局業界は、医師が発行する処方箋の流れに沿って成り立っています。診療所や病院が処方箋を出し、患者が薬局に持ち込み、薬剤師が調剤と服薬指導を行い、その対価が調剤報酬として健康保険から支払われます。薬局が仕入れる医薬品は、製薬会社から医薬品卸を経て届き、その代金にあたる薬剤料が調剤医療費の7割を占めます。

2024年度末の薬局は63,203施設で、薬局で働く薬剤師は19万7,437人です。薬局は開設に都道府県の許可が必要で、調剤報酬の点数は2年ごとの改定で国が決めるため、価格競争ではなく立地と機能で処方箋を集める構造になっています。

⇒業界構造を詳しく見る

主要プレイヤーと競争環境

薬局の担い手は、上場する調剤チェーン、非上場の大手、調剤を併設するドラッグストア、中小・個人薬局の4つに分かれます。上場最大手のアインホールディングスは連結売上6,478億円(2026年4月期)で、クオールホールディングスなどが続きます。日本調剤(2025年12月に非公開化)や総合メディカルのように上場企業の枠外にある大手もあり、さくら薬局を運営するクラフトは2025年8月にアインの子会社になりました。

スギホールディングスやツルハホールディングスなどのドラッグストアは、物販の集客力を持つ店舗に調剤を併設して処方箋を取り込み、調剤専業チェーンと競合しています。一方で薬局の大半は中小・個人経営で、法人立の保険薬局の損益差額率は4.9%(2024年度)にとどまり、後継者難と報酬改定への対応が再編を促しています。

⇒主要プレイヤーの業績比較を見る

制度と報酬改定

調剤薬局の収入は調剤報酬で決まり、厚生労働省と中央社会保険医療協議会が2年ごとに点数を改定します。令和8年度改定は診療報酬本体+3.09%(令和8年度と9年度の2年度平均。賃上げ・物価対応分を除いた各科の配分で調剤は+0.08%)、薬価▲0.86%で、調剤基本料の見直しによる門前薬局の是正、かかりつけ薬剤師の実績評価、後発医薬品調剤体制加算の撤廃を盛り込みました。

薬局の機能を示す制度として、地域の医療機関と連携する地域連携薬局(4,292件)、がん治療などに対応する専門医療機関連携薬局(225件)、健康サポート薬局(3,592件)の認定・届出制度があります。医療DXでは電子処方箋の運用を始めた薬局が85.5%に達し、オンライン資格確認と合わせて処方情報の電子的な連携が広がっています。

⇒2026年の報酬改定を詳しく見る

業界の3大論点

01

「門前」から「かかりつけ・地域」への移行はなぜ10年で進まなかったのか?

厚生労働省は2015年に「患者のための薬局ビジョン」を示し、2025年までにすべての薬局がかかりつけ機能を持ち、2035年には立地も病院の前から地域へ移すという目標を掲げました。しかし2024年8月時点で、特定の医療機関からの処方箋が95%以上を占める薬局の割合は17.3%と、2015年の14.0%からむしろ増えています。85%以上でみても32.5%から39.3%へ上がり、いわゆる門前薬局は減っていません。

背景には、処方箋が発行される場所に薬局を置くことの経済合理性があります。患者が地域のどの薬局にも処方箋を持ち込む面分業に対し、門前薬局は特定の医療機関の処方箋を受け付ける形です。処方箋の6割弱は診療所から発行され、患者は診察の直後に近くの薬局で薬を受け取ります。薬局にとっては医療機関の隣に出店すれば処方箋を安定して確保でき、医療モールのように医療機関と薬局を一体で開発する事例も増えました。かかりつけ薬剤師指導料などの報酬上の誘導はありましたが、立地の優位を覆すほどの差にはなりませんでした。

令和8年度改定は、この構図に直接手を入れる内容です。都市部で処方箋の受付回数が少なく集中率が高い新規開設薬局の評価を引き下げ、同一グループの店舗数が300以上の区分を撤廃し、医療モール関係の薬局の集中率の計算方法も見直します。かかりつけ薬剤師の評価も、包括的な指導料を廃止して電話でのフォローや残薬調整などの実績で評価する形へ転換しました。立地ではなく機能で報酬が決まる方向へ、制度側が踏み込んだ形です。

02

調剤薬局はどこで利益を出し、ドラッグストアの調剤併設とどう競うのか?

調剤薬局の収入は、薬の代金である薬剤料と、調剤や服薬指導の対価である技術料に分かれます。2024年度の調剤医療費8兆4,008億円のうち薬剤料が72.1%を占めますが、その大半は医薬品の仕入れ代金として卸に支払われるため、薬局の利益の源泉は技術料と、薬価と仕入れ値の差である薬価差です。第25回医療経済実態調査によると、法人立の保険薬局の損益差額率(収益に対する利益の割合)は4.9%(2024年度)で、1施設当たりの収益1億7,973万円に対し、費用の63.2%が医薬品等費、18.2%が給与費でした。

薄い利益率のもとで規模を生かせるのが、上場チェーンとドラッグストアです。アインホールディングスは売上6,478億円(2026年4月期)で営業利益298億円を確保し、共同購入や在庫の集約で仕入れ条件を整えています。一方、スギホールディングスやツルハホールディングスなどのドラッグストアは、物販の集客力を持つ店舗に調剤を併設し、処方箋を受け取るついでに日用品を買う動線を作ることで、調剤単体の薄い利益を物販で補う構造を持っています。

両者は同じ処方箋を奪い合う関係にあり、住宅地の面分業が進むほどドラッグストアの立地優位が効きます。調剤専業チェーンは、在宅医療や高度な薬学管理、医療機関との連携といった対人業務での差別化を迫られており、令和8年度改定が対人業務の実績評価へ移ることは、専業側にとって追い風にも試練にもなります。

03

日本調剤の非公開化は業界再編の始まりか?

2025年、業界2位級の日本調剤は投資ファンドのアドバンテッジパートナーズなどによる株式公開買い付けを受け入れ、12月に東証プライムの上場を廃止しました。2025年3月期の連結売上は3,605億円、調剤薬局は753店と規模は大きい一方、営業利益は62億円と前の期の91億円から減っており、傘下の後発医薬品メーカーの製造管理問題への対応も重なっていました。上場企業として四半期ごとの業績に縛られずに、店舗の統廃合や製造事業の立て直しを進めるための選択だとみられます。

再編の圧力は業界全体に及んでいます。薬局の大半は中小・個人経営で、経営者の高齢化と後継者難が進むなか、調剤報酬は2年ごとの改定で絞られ、電子処方箋や薬歴の電子化などの投資も欠かせません。医療経済実態調査で法人薬局の損益差額率が5%前後にとどまる構造では、単独で投資を続けるのは難しく、チェーンによる買収や事業承継が受け皿になります。

買い手側も一様ではありません。調剤専業チェーンは地域密着の薬局を取り込んで店舗網を広げ、ドラッグストアは調剤併設で処方箋を取り込みます。投資ファンドが大手を非公開化した事例は、規模の大きい薬局チェーンでも再編の対象になりうることを示しました。今後は、上場の枠外で進む統合と、報酬改定による門前薬局の是正が重なり、薬局の数と担い手の姿がゆっくりと変わっていく局面に入ります。

よくある質問 (FAQ)

調剤薬局の市場規模はどれくらいですか?
市場規模にあたる調剤医療費(電算処理分)は、2024年度に8兆4,008億円で前年度比+1.6%でした。2012年度の6兆5,902億円から12年間で約1.8兆円増えています。内訳は薬剤料が6兆592億円(72.1%)、技術料が2兆3,251億円(27.7%)です。紙のレセプトを含む全数ベースでは総額8兆4,347億円で、処方箋枚数は8億9,859万枚、処方箋1枚当たりの調剤医療費は9,387円です。
薬局は全国に何軒ありますか?
厚生労働省の衛生行政報告例によると、2024年度末の薬局数は63,203施設で、前年度から375施設増えました。2019年度末の60,171施設から5年間で約3,000施設増えています。人口10万人あたりでは全国平均51.1施設で、佐賀県の65.1施設が最も多く、沖縄県の39.4施設が最も少なくなっています。施設数では東京都の7,215施設が最多です。
医薬分業率とは何ですか? どこまで進んでいますか?
医薬分業率は、医療機関の外来で投薬の対象となった患者のうち、院外の薬局で処方箋を受け取った割合を推計したもので、日本薬剤師会が処方箋受取率として公表しています。2025年度は82.2%で、2020年度の75.7%から上がり、2023年度に初めて80%を超えました。都道府県差が大きく、最も高い秋田県の94.0%に対し、最も低い和歌山県は66.6%です。80%を超えてからの伸びは小さく、量的な拡大は成熟期に入っています。
調剤薬局の大手はどこですか?
上場企業ではアインホールディングスが最大手で、2026年4月期の連結売上は6,478億円です。クオールホールディングス(2,908億円)、メディカルシステムネットワーク(1,322億円)、ファーマライズホールディングス(695億円)が続きます。日本調剤は2025年3月期に連結売上3,605億円の業界2位級ですが、2025年12月に上場を廃止しました。さくら薬局を運営するクラフトは2025年8月にアインの子会社となりました。このほか総合メディカル(そうごう薬局、2020年に非公開化)が非上場の大手で、スギホールディングスやツルハホールディングスなどのドラッグストアも調剤併設で大きな処方箋枚数を扱っています。
日本調剤はなぜ上場廃止になったのですか?
日本調剤は2025年7月に投資ファンドのアドバンテッジパートナーズなどによる株式公開買い付けの受け入れを発表し、成立を経て2025年12月19日に東証プライムの上場を廃止しました。2025年3月期は連結売上3,605億円、営業利益62億円で、前の期の91億円から減益となり、傘下の後発医薬品メーカーの製造管理問題への対応も続いていました。上場を離れて店舗の収益改善や製造事業の立て直しを進める狙いとみられます。
門前薬局とは何ですか? 何が問題視されていますか?
門前薬局は、特定の医療機関の近くに立地し、その医療機関の処方箋を主に受け付ける薬局です。厚生労働省の集計では、処方箋集中率が95%以上の薬局の割合は2015年の14.0%から2024年の17.3%へ増えています。2015年の「患者のための薬局ビジョン」は、患者がかかりつけの薬局で薬を一元的に管理する姿を目標にしましたが、立地に依存する構造は変わらず、令和8年度改定では都市部の集中率が高い新規開設薬局の評価引き下げなど、門前偏重の是正が盛り込まれました。
2026年の調剤報酬改定で何が変わりますか?
令和8年度診療報酬改定の改定率は、本体が+3.09%(令和8年度と9年度の2年度平均)、賃上げ・物価対応分を除いた各科の配分で調剤は+0.08%、薬価が▲0.86%です。調剤では、面分業を促すための調剤基本料の見直し、かかりつけ薬剤師指導料と包括管理料の廃止と実績に基づく評価への転換、地域支援体制加算の地域支援・医薬品供給対応体制加算への改称、後発医薬品調剤体制加算の撤廃とバイオ後続品調剤体制加算の新設、薬局の賃上げに対応する調剤ベースアップ評価料などが主な内容です。薬価は2026年4月、報酬本体は6月に施行されます。
調剤薬局の利益率はどれくらいですか?
中央社会保険医療協議会の第25回医療経済実態調査によると、2024年度の保険薬局の損益差額率は法人立で4.9%、個人立で11.3%でした。個人立は開設者の報酬が費用に含まれないため高く出る点に注意が必要です。法人立の1施設当たりの収益は1億7,973万円で、費用の63.2%が医薬品等費、18.2%が給与費です。1施設当たりの年間処方箋枚数は約1万7,000枚でした。
ドラッグストア
調剤併設で処方箋を取り込む隣接業態。スギ・ツルハ・サンドラッグなど
医薬品卸準備中
薬局へ医薬品を供給する流通の担い手。メディパル・アルフレッサ・スズケン・東邦
医薬・バイオ製造準備中
薬価と後発医薬品の供給が調剤医療費の薬剤料を左右する
コンビニエンスストア
店舗網の広がりを比べる際の参照業態

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参考資料 / 一次ソース

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